Это версия Qt для команды qmake, найденной в вашей переменной окружения PATH. Скорее всего это версия Qt системы.
Qt проекта
Версия Qt, настроенная в режиме Проекты на вкладке Настройки сборки в поле Профиль Qt. Это версия Qt, которая используется для конкретного проекта.
Теневая сборка
Теневая сборка означает сборку проекта в отдельном каталоге, каталоге сборки. Каталог сборки отличается от каталога исходных кодов. Один из плюсов теневой сборки в том, что она сохраняет ваш каталог исходных кодов чистым. Теневая сборка это лучшее решение если вам требуется много конфигураций сборки для одного набора исходников.